Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M10.3Q85ZW6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms