Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg2bQ80XK6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg2bQ80XK6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2bQ80XK6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms