Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc155Q80VJ8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms