Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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