Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ClmQ7TSN2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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