Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ckap2lQ7TS74 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms