Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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