Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Eci3Q78JN3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms