Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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