Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Timd4Q6U7R4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms