Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms