Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zbtb40Q6PCS8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbtb40Q6PCS8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms