Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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