Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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