Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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