Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Krt40Q6IFX3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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