Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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