Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Irf4Q64287 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irf4Q64287 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Irf4Q64287 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Irf4Q64287 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Irf4Q64287 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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