Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Nhlh2Q64221 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Nhlh2Q64221 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nhlh2Q64221 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms