Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.7 ms