Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mre11Q61216 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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