Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trim38Q5SZ99 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trim38Q5SZ99 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trim38Q5SZ99 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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