Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbm27Q5SFM8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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