Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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