Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc27Q3V036 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc27Q3V036 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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