Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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