Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Gm28047Q3US59 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28047Q3US59 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28047Q3US59 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28047Q3US59 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Gm28047Q3US59 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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