Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Hdgfl2Q3UMU9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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