Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms