Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms