Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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