Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms