Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms