Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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