Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp39Q3TIX9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Usp39Q3TIX9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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