Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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