Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VgfQ0VGU4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VgfQ0VGU4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms