Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ttc39dQ0VF76 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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