Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms