Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms