Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Calb2Q08331 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Calb2Q08331 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms