Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Nf1Q04690 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms