Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms