Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl7Q03366 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms