Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfiaQ02780 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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