Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms