Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HmgcrQ01237 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HmgcrQ01237 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms