Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms