Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms