Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeleQ00690 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms